整合 bulk-RNA 和 scRNA 数据研究免疫细胞极化状态与肺腺癌预后的关系

使用Scupa进行免疫细胞极化状态评估，BayesPrism可利用 scRNA 为参考集，标记 bulkRNA 中每个样本细胞比例和基因表达量，研究不同极化情况对预后的影响。scissor 可利用 bulkRNA及每个样本的注释 为参考集，将 scRNA 中的细胞分为scissor+和 scissor-两类，分别表示与注释正相关和负相关，研究不同极化状态的细胞的分布是否和scissor+、scissor-细胞有相似。scAB也可以达到与 scissor 类似的效果

bulkRNA：TCGA-LUAD