Skip to content

Commit 2482f98

Browse files
committed
Added thresholds for missing metabolic genes
1 parent 0b02d85 commit 2482f98

File tree

2 files changed

+716
-670
lines changed

2 files changed

+716
-670
lines changed

task_data/Ensembl2symbol_human.csv

+36-3
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -4218,6 +4218,7 @@ ACOX3,ENSG00000087008
42184218
ACOXL,ENSG00000153093
42194219
ACP1,ENSG00000143727
42204220
ACP2,ENSG00000134575
4221+
ACP3,ENSG00000014257
42214222
ACP4,ENSG00000142513
42224223
ACP5,ENSG00000102575
42234224
ACP6,ENSG00000162836
@@ -4432,6 +4433,8 @@ ADRB3,ENSG00000188778
44324433
ADRM1,ENSG00000130706
44334434
ADSL,ENSG00000239900
44344435
ADSS,ENSG00000035687
4436+
ADSS1,ENSG00000185100
4437+
ADSS2,ENSG00000035687
44354438
ADSSL1,ENSG00000185100
44364439
ADTRP,ENSG00000111863
44374440
AEBP1,ENSG00000106624
@@ -6184,6 +6187,7 @@ ALOX15B,ENSG00000179593
61846187
ALOX5,ENSG00000012779
61856188
ALOX5AP,ENSG00000132965
61866189
ALOXE3,ENSG00000179148
6190+
ALPG,ENSG00000163286
61876191
ALPI,ENSG00000163295
61886192
ALPK1,ENSG00000073331
61896193
ALPK2,ENSG00000198796
@@ -8874,6 +8878,7 @@ CERS3-AS1,ENSG00000259430
88748878
CERS4,ENSG00000090661
88758879
CERS5,ENSG00000139624
88768880
CERS6,ENSG00000172292
8881+
CERT1,ENSG00000113163
88778882
CES1,ENSG00000198848
88788883
CES2,ENSG00000172831
88798884
CES3,ENSG00000172828
@@ -9435,14 +9440,17 @@ CORO2B,ENSG00000103647
94359440
CORO6,ENSG00000167549
94369441
CORO7,ENSG00000262246
94379442
COTL1,ENSG00000103187
9443+
COX1,ENSG00000198804
94389444
COX10,ENSG00000006695
94399445
COX11,ENSG00000166260
94409446
COX15,ENSG00000014919
94419447
COX16,ENSG00000133983
94429448
COX17,ENSG00000138495
94439449
COX18,ENSG00000163626
94449450
COX19,ENSG00000240230
9451+
COX2,ENSG00000198712
94459452
COX20,ENSG00000203667
9453+
COX3,ENSG00000198938
94469454
COX4I1,ENSG00000131143
94479455
COX4I2,ENSG00000131055
94489456
COX5A,ENSG00000178741
@@ -9459,6 +9467,7 @@ COX7B,ENSG00000131174
94599467
COX7B2,ENSG00000170516
94609468
COX7C,ENSG00000127184
94619469
COX8A,ENSG00000176340
9470+
COX8C,ENSG00000187581
94629471
CP,ENSG00000047457
94639472
CPA1,ENSG00000091704
94649473
CPA2,ENSG00000158516
@@ -9877,6 +9886,7 @@ CYSLTR1,ENSG00000173198
98779886
CYSLTR2,ENSG00000152207
98789887
CYSRT1,ENSG00000197191
98799888
CYSTM1,ENSG00000120306
9889+
CYTB,ENSG00000198727
98809890
CYTH1,ENSG00000108669
98819891
CYTH2,ENSG00000105443
98829892
CYTH3,ENSG00000008256
@@ -10251,6 +10261,7 @@ DLX6-AS1,ENSG00000231764
1025110261
DM1-AS,ENSG00000267395
1025210262
DMAC1,ENSG00000137038
1025310263
DMAC2,ENSG00000105341
10264+
DMAC2L,ENSG00000125375
1025410265
DMAP1,ENSG00000178028
1025510266
DMBT1,ENSG00000187908
1025610267
DMC1,ENSG00000100206
@@ -11535,6 +11546,7 @@ FCRL3,ENSG00000160856
1153511546
FCRL5,ENSG00000143297
1153611547
FCRL6,ENSG00000181036
1153711548
FCRLB,ENSG00000162746
11549+
FCSK,ENSG00000157353
1153811550
FDFT1,ENSG00000079459
1153911551
FDPS,ENSG00000160752
1154011552
FDX1,ENSG00000137714
@@ -11895,6 +11907,7 @@ G2E3-AS1,ENSG00000257636
1189511907
G3BP1,ENSG00000145907
1189611908
G3BP2,ENSG00000138757
1189711909
G6PC,ENSG00000131482
11910+
G6PC1,ENSG00000131482
1189811911
G6PC2,ENSG00000152254
1189911912
G6PC3,ENSG00000141349
1190011913
G6PD,ENSG00000160211
@@ -12025,6 +12038,7 @@ GATD3A,ENSG00000160221
1202512038
GATD3B,ENSG00000280071
1202612039
GATM,ENSG00000171766
1202712040
GBA,ENSG00000177628
12041+
GBA1,ENSG00000177628
1202812042
GBA2,ENSG00000070610
1202912043
GBA3,ENSG00000249948
1203012044
GBE1,ENSG00000114480
@@ -12094,6 +12108,8 @@ GEMIN6,ENSG00000152147
1209412108
GEMIN7-AS1,ENSG00000267348
1209512109
GEMIN8,ENSG00000046647
1209612110
GEN1,ENSG00000178295
12111+
GET1,ENSG00000182093
12112+
GET3,ENSG00000198356
1209712113
GET4,ENSG00000239857
1209812114
GFER,ENSG00000127554
1209912115
GFI1,ENSG00000162676
@@ -12108,6 +12124,7 @@ GFRA1,ENSG00000151892
1210812124
GFRA2,ENSG00000168546
1210912125
GFRA3,ENSG00000146013
1211012126
GFRAL,ENSG00000187871
12127+
GFUS,ENSG00000104522
1211112128
GGA1,ENSG00000100083
1211212129
GGA2,ENSG00000103365
1211312130
GGA3,ENSG00000125447
@@ -12120,6 +12137,7 @@ GGNBP2,ENSG00000278311
1212012137
GGPS1,ENSG00000152904
1212112138
GGT1,ENSG00000100031
1212212139
GGT2,ENSG00000133475
12140+
GGT2P,ENSG00000133475
1212312141
GGT5,ENSG00000099998
1212412142
GGT6,ENSG00000167741
1212512143
GGT7,ENSG00000131067
@@ -12613,13 +12631,15 @@ GTPBP8,ENSG00000163607
1261312631
GTSCR1,ENSG00000263417
1261412632
GTSE1,ENSG00000075218
1261512633
GTSF1,ENSG00000170627
12634+
GUCA1A,ENSG00000048545
1261612635
GUCA1B,ENSG00000112599
1261712636
GUCA1C,ENSG00000138472
1261812637
GUCA2A,ENSG00000197273
1261912638
GUCD1,ENSG00000138867
1262012639
GUCY1A1,ENSG00000164116
1262112640
GUCY1A2,ENSG00000152402
1262212641
GUCY1B1,ENSG00000061918
12642+
GUCY1B2,ENSG00000123201
1262312643
GUCY2C,ENSG00000070019
1262412644
GUCY2D,ENSG00000132518
1262512645
GUCY2F,ENSG00000101890
@@ -15989,6 +16009,7 @@ MARCH6,ENSG00000145495
1598916009
MARCH7,ENSG00000136536
1599016010
MARCH8,ENSG00000165406
1599116011
MARCH9,ENSG00000139266
16012+
MARCHF6,ENSG00000145495
1599216013
MARCKS,ENSG00000277443
1599316014
MARCKSL1,ENSG00000175130
1599416015
MARCO,ENSG00000019169
@@ -16451,6 +16472,7 @@ MMRN1,ENSG00000138722
1645116472
MMRN2,ENSG00000173269
1645216473
MMS19,ENSG00000155229
1645316474
MMS22L,ENSG00000146263
16475+
MMUT,ENSG00000146085
1645416476
MN1,ENSG00000169184
1645516477
MNAT1,ENSG00000020426
1645616478
MND1,ENSG00000121211
@@ -17094,6 +17116,13 @@ NCR3,ENSG00000204475
1709417116
NCR3LG1,ENSG00000188211
1709517117
NCS1,ENSG00000107130
1709617118
NCSTN,ENSG00000162736
17119+
ND1,ENSG00000198888
17120+
ND2,ENSG00000198763
17121+
ND3,ENSG00000198840
17122+
ND4,ENSG00000198886
17123+
ND4L,ENSG00000212907
17124+
ND5,ENSG00000198786
17125+
ND6,ENSG00000198695
1709717126
NDC1,ENSG00000058804
1709817127
NDC80,ENSG00000080986
1709917128
NDE1,ENSG00000072864
@@ -18947,7 +18976,7 @@ PPFIBP2,ENSG00000166387
1894718976
PPHLN1,ENSG00000134283
1894818977
PPIA,ENSG00000196262
1894918978
PPIAL4A,ENSG00000263353
18950-
PPIAL4C,ENSG00000263464
18979+
PPIAL4C,ENSG00000288867
1895118980
PPIAL4E,ENSG00000271567
1895218981
PPIAL4G,ENSG00000236334
1895318982
PPIB,ENSG00000166794
@@ -19308,6 +19337,7 @@ PSMA7,ENSG00000101182
1930819337
PSMA8,ENSG00000154611
1930919338
PSMB1,ENSG00000008018
1931019339
PSMB10,ENSG00000205220
19340+
PSMB11,ENSG00000222028
1931119341
PSMB2,ENSG00000126067
1931219342
PSMB3,ENSG00000277791
1931319343
PSMB4,ENSG00000159377
@@ -19338,6 +19368,7 @@ PSMD6-AS1,ENSG00000243410
1933819368
PSMD6-AS2,ENSG00000239653
1933919369
PSMD7,ENSG00000103035
1934019370
PSMD8,ENSG00000099341
19371+
PSMD9,ENSG00000110801
1934119372
PSME1,ENSG00000092010
1934219373
PSME2,ENSG00000100911
1934319374
PSME3,ENSG00000131467
@@ -19391,6 +19422,7 @@ PTGFRN,ENSG00000134247
1939119422
PTGIR,ENSG00000160013
1939219423
PTGIS,ENSG00000124212
1939319424
PTGR1,ENSG00000106853
19425+
PTGR3,ENSG00000180011
1939419426
PTGS1,ENSG00000095303
1939519427
PTGS2,ENSG00000073756
1939619428
PTH,ENSG00000152266
@@ -21300,7 +21332,6 @@ SLC37A1,ENSG00000160190
2130021332
SLC37A2,ENSG00000134955
2130121333
SLC37A3,ENSG00000157800
2130221334
SLC37A4,ENSG00000137700
21303-
SLC37A4,ENSG00000281500
2130421335
SLC38A1,ENSG00000111371
2130521336
SLC38A10,ENSG00000157637
2130621337
SLC38A11,ENSG00000169507
@@ -21703,7 +21734,7 @@ SOCS5,ENSG00000171150
2170321734
SOCS6,ENSG00000170677
2170421735
SOCS7,ENSG00000274211
2170521736
SOD1,ENSG00000142168
21706-
SOD2,ENSG00000112096
21737+
SOD2,ENSG00000291237
2170721738
SOD2-1,ENSG00000285441
2170821739
SOD3,ENSG00000109610
2170921740
SOGA1,ENSG00000149639
@@ -23120,6 +23151,7 @@ TMEM89,ENSG00000183396
2312023151
TMEM8A,ENSG00000129925
2312123152
TMEM8B,ENSG00000137103
2312223153
TMEM9,ENSG00000116857
23154+
TMEM91,ENSG00000142046
2312323155
TMEM92,ENSG00000167105
2312423156
TMEM92-AS1,ENSG00000251179
2312523157
TMEM94,ENSG00000177728
@@ -24183,6 +24215,7 @@ VMP1,ENSG00000062716
2418324215
VNN1,ENSG00000112299
2418424216
VNN2,ENSG00000112303
2418524217
VNN3,ENSG00000093134
24218+
VNN3P,ENSG00000093134
2418624219
VOPP1,ENSG00000154978
2418724220
VPS11,ENSG00000160695
2418824221
VPS13A,ENSG00000197969

0 commit comments

Comments
 (0)