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dreamfly999/Figure

 
 

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Figure 文件说明

bar_plot.py 为画柱状图的脚本

Broken_Axis.py 为对纵坐标进行截断的脚本

get_qpcr_reslut.py 包含一个自定义函数,可对qpcr数据直接分析出图

get_qpcr_reslut.py 参数说明


file_name='realtime.xls': qpcr文件,文件中样本名称需设置的格式为 sample_name-treat,样本名在前,处理条件在后,否则该模块无法识别,

sample_name=[]: 样本的名称,用逗号隔开,需和qpcr的xls文件中的样本名称保持一致,如 ['col','m1','m2','m3']

treat=[]: 处理的条件名称,用逗号隔开,如 [0,1,2]

color_set=[]: 自定义设置颜色,颜色数目需和样本数目保持一致

target1='mock': target1 必须为对照的引物,和xls文件保持一致

target2='condition': 另一个引物名称

cut='no': 默认为不对柱状图进行截断,修改为 'yes' 可进行截断

ax_setylim=100: 截断是上面部分默认为100

ax2_setylim=10: 截断是下面部分默认为10

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