Ce repository rassemble la documentation pour l'utilisation des outils partagés. Il sera mis à jour au fur et à mesure que de nouveaux outils seront ajoutés.
- AraDEEPopsis_utilisateur
Décrit l'utilisation de l'outil AraDEEPopsis pour l'analyse des suivis de croissance.
araDEEPopsis: From images to phenotypic traits using deep transfer learning. Patrick Hüther, Niklas Schandry, Katharina Jandrasits, Ilja Bezrukov, Claude Becke - Gregor-Mendel-Institute - Vienne https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.01.018192v2
- GraphicsMagick_utilisateur
Décrit l'utilisation de certaines fonctions de l'outil GraphicsMagick pour la préparation des photos dans le but d'enf aire l'analyse avec AraDEEPopsis : redimenssionement, découpage ...
- chcase_change_file_name
chcase est un utilitaire qui permet de modifier le nom d'une liste de fichiers en une seule commande en identifiant un pattern à modifier ou remplacer.