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Author: digoal

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@@ -4,10 +4,10 @@ PostgreSQL凭借良好的扩展性，不仅仅是一个数据库，更是一个
 本文给大家分享的是PostgreSQL在生命科学领域的应用案例 - 基因工程。    
 
 通常的思维可能是这样的，把数据存在数据库，需要运算的时候，再把数据取出进行运算（例如配对），需要花费非常多的网络传输时间。    
-![1](1.png)
+![1](20160621_1_1.png)
 
 PostgreSQL提供了基因工程相关的数据类型，操作类型，索引。满足基因工程业务的需求。  你甚至可以利用MPP来解决更大数据量的问题（例如压缩后百TB级别）。    
-![2](2.png)
+![2](20160621_1_2.png)
 
 并行计算请参考    
 https://yq.aliyun.com/articles/44655  
@@ -17,43 +17,43 @@ https://wiki.postgresql.org/wiki/PGStrom
 ## 背景知识
 染色体DNA的数字化，由4种最基本的腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）与鸟嘌呤的（G）排列组成。  
 染色体长度从几千到几十亿不等。  
-![1](3.png)
+![1](20160621_1_3.png)
 
 由于DNA过长，不利于分析，所以有了RNA，RNA是一些更短的ATCG基本排列，通常是50到1万的长度。  
 每个DNA由一些RNA排列组成(其中可能会有一些重复)。  
-![2](4.png)
+![2](20160621_1_4.png)
 
 基因测序，目的是找出两组DNA的相似和不同的地方。  
-![3](5.png)
+![3](20160621_1_5.png)
 
 DNA的压缩，前面讲了DNA实际上是由ATCG排列而成，长度从几千到几十亿不等。  
 所以压缩存储非常重要，PostBIS提供了很好的压缩算法解决压缩效率和解压效率的问题。  
-![4](https://oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/yqfiles/122a82178812eb763f03d5ef95d5d808e19b261a.png)
+![4](20160621_1_6.png)
 
 PostBIS提供的数据类型  
-![5](https://oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/yqfiles/7401459a357c648b812a03bbaa362c769b652fd2.png)
+![5](20160621_1_7.png)
 
 几种压缩效率对比  
-![6](https://oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/yqfiles/b87a93157122920ae5f79920434713773fd8f6a1.png)
+![6](20160621_1_8.png)
 
 DNA编码效率对比  
-![7](https://oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/yqfiles/a4d90158980b438f8823874407c4a155490a21be.png)
+![7](20160621_1_9.png)
 
 对比常用的压缩算法和PostBIS压缩算法的压缩比  
-![8](https://oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/yqfiles/ef0805406ab8626e8089c6abd0b45b7b97d77d13.png)
+![8](20160621_1_10.png)
 
 对比常用的压缩算法和PostBIS压缩算法的压缩效率  
-![9](https://oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/yqfiles/23ed5c8df9c4534c4c4f9ee576c3ec442b0801e5.png)
+![9](20160621_1_11.png)
 
 基因数据存储到数据库后，能干什么？  
-![10](https://oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/yqfiles/213afaea0d4b37679aadec2c94166d58360a2d45.png)
+![10](20160621_1_12.png)
 
 PostBIS 基因抽取的效率和基因长度无关，是O(1)的.
-![11](https://oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/yqfiles/235f5af66488bdf79b4e1240e172efe29113e2a8.png)
+![11](20160621_1_13.png)
 
 ## PostgreSQL 如何支撑基因工程应用
 PostBIS支持的数据类型  
-![1](https://oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/yqfiles/0280bbc200f07ffeb160d898d1d1650a9310fec1.png)
+![1](20160621_1_14.png)
 
 使用例子
 ```
@@ -115,9 +115,9 @@ GROUP BY id, matching_cds;
 
 ## 应用举例  
 纯笔者YY，也许将来有临床经验了，可以包装成商业化的产品。  
-![1](https://oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/yqfiles/2aaa0580210e5e1df87f3812eb9d869e58418b86.png)
-![2](https://oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/yqfiles/56cadc587df95d8dc02ad6d4406565e4d0ade5e4.png)
-![3](https://oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/yqfiles/4a44df352ca07c049f1ca0eb2926037ec9e5f400.png)
+![1](20160621_1_15.png)
+![2](20160621_1_16.png)
+![3](20160621_1_17.png)
 
 互联网抓来的基因相关的例子