Politechnika Warszawska, MI^2
MLExpResso – NGS, Metylacja, Expresja, R i sporo kawy
W naszym wystąpieniu przedstawimy MLExpResso - pakiet służący do jednoczesnej analizy i wizualizacji danych dotyczących ekspresji genów oraz metylacji DNA. Kluczowymi funkcjami pakietu są:
-
Identyfikacja regionów o zróżnicowanej metylacji (DMR),
-
Identyfikacja genów o zmienionej ekspresji,
-
Identyfikacja regionów ze zmianami w ekspresji i metylacji,
-
Wizualizacja zidentyfikowanych regionów.
Wspólne modelowanie i wizualizacja ekspresji oraz metylacji zwiększa interpretowalność zidentyfikowanych sygnałów.